電影: Atsuko Yuya

柯南與少年偵探團受邀來到八丈島海域賞鯨，卻意外捲入黑暗組織的陰謀事件。柯南收到赤井秀一的消息，得知有一位歐洲刑警機構職員遭到琴酒殺害，於是決定潛入海洋設施「太平洋浮標」進行調查，然而在調查過程中，灰原哀的生命卻陷入險境。柯南能否順利救出灰原？灰原的真實身分是否會被發現？新的黑影PINGA又是誰？...

17歲的高二少女紺野真琴，和死黨津田功介及間宮千昭放學一起打棒球，三人總是成天混在一起。然而有一天，她從魔女阿姨身上獲得了「跳躍時空」的能力，平凡的日常從此改變，真琴不斷重溫那美好單純的夏日，逐漸掌握使用能力的方法，但在一個偶然的機緣下，千昭卻向她表白，讓她不知該如何是好⋯...

海外超人氣偶像艾米里歐前往日本舉行演唱會，但他卻收到一封來自神秘組織的黑函，要求他停止演唱會，否則就會喪命。艾米里歐求救於毛利小五郎時，柯南也發現魯邦一夥計畫在艾米里歐演唱會的當日竊取秘寶：櫻桃藍寶石。 演唱會當日，五萬人雲集東都體育場，少年偵探團的小夥伴們也參與盛會，柯南與灰原哀潛行其中，尋找櫻桃藍寶石交易的嫌疑人。而魯邦、警方懷著各自的目的暗中展開行動。霎時間，偵探、盜賊、員警以及某神秘組織在喧囂吵鬧的運動場進行激烈的角力。 柯南認為，對超人氣偶像的恐嚇、夢幻秘寶的盜竊事件、逼近身邊的神...

故事講述柯南他們前往位於太平洋中的美麗小島「神海島」渡假。這座島嶼自古流傳著一則有關於沉沒在海底的古代遺跡「海底宮殿」，以及300年前實際存在的女海盜「安妮·邦尼」、「瑪麗·瑞德」所遺留下來的寶藏傳說。...

專針對警察的連續殺人案件發生了，警察內部引起巨大的回響。對於想得到案件情報的小五郎，目暮警部卻意外地守口如瓶。看到如此情況的柯南，聯想到事情可能和警察內部有莫大的關係。然後，下一個被槍擊的目標居然是佐藤刑警，剛巧在案發現場出現的小蘭受到案件的刺激而被弄至失憶。犯人為了殺人滅口，於是企圖把唯一的目擊證人殺害。深知情況嚴重的柯南，為了保護小蘭，不惜孤身犯險去把犯人找出來。...

15年前，貨輪「第一八代丸」在北太平洋海上撞上冰山發生沉沒事故。沖田船長與三等航海士2人身亡。且在半個月前，八代造船的的船舶設計人八代英人在駕駛時心臟病發，墜落懸崖身亡。不同年代的2個事件，是將豪華客船的乘務員與乘客捲入巨大陰謀的序章。 由於園子的邀請，柯南一行人受邀參與豪華客船「愛芙羅黛蒂號」的處女航儀式。一行人開心的參觀郵輪。一行人開始在船內玩起捉迷藏。可是在捉迷藏進行中時，園子突然被人綁架監禁了起來。透過柯南的推理，平安地救出了園子。但這次，八代造船的社長——八代貴江被人刺殺，會長八代延...

小五郎應京都寺院的邀請，前往京都調查寺內八年前佛像盜竊事件。寺院早前得到佛像下落的線索，是一件有不同圖案的圖畫，提供給小五郎，以便儘快尋回佛像。同時間，東京、大阪和京都發生殺人事件，三個城市的警方調查後，發現事件中的死者都是盜賊團「源氏螢」的成員，毎人都有一個代名，以《義經》內的傳統人物命名。服部亦因此事，前往京都調查殺人事件的真相。期間遇上柯南，兩人一起調查兩宗事件，發現兩宗事件都有共同點，有助解開八年前佛像盜竊事件。在調查期間亦發生殺人案，服部因此而受襲，和葉亦因查找施襲者線索而被人挾持。...

最近發生一連串音樂家遭到殺害的事件，而所有被害者生前都曾在某個知名鋼琴家所舉辦的音樂學校上過課。某日，柯南一行人受邀前往參加這位鋼琴家所興建的音樂廳之落成紀念音樂會，在這場世界著名音樂家雲集的音樂會中，最受矚目的主角是一名天才女歌手，沒想到卻傳出有人企圖暗殺這名女歌手的消息；雖然柯南在千鈞一髮之際出手相救，讓她得以躲過殺手的暗殺，但犯人並未就此放棄，反而將欲殺害的目標轉移到柯南等人身上。犯人的魔掌不斷朝著柯南等人伸出，他這麼做的目的，難道是想要阻撓這場音樂會嗎？ 音樂會當天，柯南在進入會場之前...

世界最大的體育盛會「WSG -World Sports Games-」暌違多年將在東京舉辦。日本為盛大舉行開幕儀式，展現日本最尖端技術──世界首創最高時速1000km的「真空超電導新幹線」，在新名古屋站和東京之間開通！在世人目光的注視下，知名大會贊助商匯集的會場中，各大企業老闆光天化日下相繼被綁架。此時，卻發現赤井秀一竟在背地監視，並指揮FBI成員們的行動。同時，柯南想起15年前在美國波士頓發生的驚悚WSG連續綁架事件也是由FBI負責偵查，或許這一場事件，敵人就是自己人，然而各種證據顯示出的不在...

朝倉市長收到一封神秘的恐嚇信，內容為：「對於你那4年執政中桀驁不馴的態度，上天將給予懲罰！」。隔天，由市長主導開通的新地下鐵隧道遭到炸毀。雖然多虧柯南知道恐嚇信而使得這次爆破事件沒有人員傷亡，但是奪取市長性命失敗的犯人勢必將再次犯案，並帶來更大的災害，調查朝倉市長歷年事政的柯南，察覺到極有可能是在國土交通大臣時代所推動的水庫建設案中，懷有恨意的犯人就在那相關關係人等之中，因此決定進行深度搜查。 因為水庫的建造，沉入湖底的新潟縣北之澤村村民遷移到鄰近土地已有5年了，在這5周年紀念的日子裡聚集了許...

在神秘委託者的招待下，小五郎與柯南一行人來到了橫濱。一行人受邀來到一座遊樂園，沒想到卻掉入黑影的神秘男子所設下的陷阱。小蘭、灰原與少年偵探團，也因此落入敵人手中成為人質。時間限制為12個小時，如果不在時間內解開男子所出的謎題，小蘭他們身上的炸彈就會爆炸。 這名男子居然知道柯南其實就是工藤新一？！這名男子的真正身份，難道是……就在同時，「關西的高中生偵探」服部平次的兒時玩伴和葉也被抓走成為了人質。追查著怪盜基德的「高中偵探始祖」白馬探，也接到了神秘男子的委託。這些偵探們將與柯南一同挑戰謎題。但是...

以635米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔（Bell Tree Tower）竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人，從眺望台上享受著絕美的景色。就在此時，一發子彈擊碎了窗戶玻璃，打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間，完全搞不清到底發生了什麼，小蘭與少年偵探團陷入恐慌。柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能，沿著彈道發現了一個黑色的身影。「從那麼遠的距離進行狙擊，怎麼可能？！」柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩托車追趕逃走的狙擊手，意想不到的是狙擊手居然連警察的巡邏車都打算一起炸掉，整個追蹤過程都...

正當東京街頭充滿萬聖節氛圍時，澀谷 HIKARIE 正在舉行婚禮，而婚禮現場有著身穿禮服的佐藤刑警。正當柯南一行人在現場觀察著來賓時，現場突然闖進了一名暴徒，而為了保護大家的高木刑警卻因此身陷危機？！雖然後來事件安全落幕，但佐藤卻回想起了 3 年前的連續爆炸案件，而當時殉職的松田刑警恰巧與高木刑警的身影重疊。 與此同時，連續爆炸案件的犯人逃獄了，究竟這一連串的事件純粹是巧合還是另有隱情？公安警察的降谷零 (安室透) 為了前往追捕逃獄的犯人，卻被神秘的偽裝男子戴上了頸圈炸彈。為了將炸彈解除而潛伏...

柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。這時候，神祕的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰!小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。在此同時，艦裏發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一隻時間停滯在上午5時30分的手錶……在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展...

11月20日（週日），東都體育場。江戶川柯南和少年偵探團等在興致勃勃地觀看東京Spirits隊與大阪鋼巴隊的足球比賽。與此同時，毛利偵探事務所的電話突然響起，是大規模爆炸的預告電話！這並不是遊戲，也絕非虛張聲勢。就像對小五郎的挑釁一樣，道路上的汽車就在他眼前發生了爆炸！要阻止接下來的爆炸只有一個辦法，就是解開犯人留下的謎樣的暗號！...

6件大範圍的連續殺人事件發生在東京周邊的數個地區。目暮警官以及曾在動畫版出現過的其他警察集合召開搜查會議，小五郎也以特別顧問的身份被邀請前去參加。此時柯南卻因為一個偶然的契機，發現一個警察從會議中離席，並乘上了保時捷356A-琴酒的車離去！！「黑暗組織」的一員居然潛入了搜查會議，連續殺人事件莫非是「黑暗組織」做下的邪惡勾當？事態一觸即發！！如果讓琴酒知道工藤新一仍然活著，那麼不只新一本人、只要是認識他的所有人也都會被組織極力剷除。所以在明知危機四伏的情況下，柯南仍然開始單獨進行調查，慢慢發現有關...

鈴木財團的顧問——鈴木次郎吉，終於完成了世界最大的飛行船「BELL TREE（「鈴木」之意）I世號」。這其實是他為了緝捕自認是競爭對手的怪盜基德，所安排的一場大規模計畫。他對怪盜基德下的戰帖是:「七天後，『BELL TREE I世號』將從東京出發到大阪，有本事就來把『天空的貴婦人』這顆大寶石給偷走吧。」 對於次郎吉的這項挑戰，基德也大膽地回覆「等抵達大阪上空後就會偷走」，這場以天空為舞台的對決也受到了世人的矚目。同時次郎吉也招待了名偵探毛利小五郎、毛利蘭、柯南、阿笠博士及少年偵探團的成員們搭乘...

一個月黑風高的晚上，某個間諜趁隙滲透日本警方，欲竊取各國情報局的機密檔案，包括英國 MI6、德國 BDN、美國 CIA，甚至還有 FBI 等各國諜報機構。幸好安室透(波本)領導的日本公安局及時趕到，間諜想利用偷來的車逃脫，於高速公路上展開激烈追逐戰，其他的車輛也被捲入，千鈞一發之際，卻被FBI探員赤井秀一的來福槍擊中，從公路墜下懸崖。 隔天，柯南一行人前往東京的一間水族館，意外發現一名受傷的女子。她的雙眼有著不同的顏色，仔細一看她的兩隻眼睛的瞳孔顏色不一樣，也就是俗稱的“陰陽眼” ，且失去了記憶...

300年後的未來（2306年），因為遺傳基因實驗失敗，產生了有思想的森林，變得襲擊人類和城市化的世界。其中有一個比較與森林友好的中立城市，就是主角阿基德生活的地方。偶然在一次偷取儲水（水在那個世界是最貴重的）的行動中，阿基德遇到在永久生命維持裝置中從沉睡中醒覺的楚拉。阿基德把她救醒，並與她成為朋友，卻萬料不到，原來這一位來自過去的女孩，身懷一個特殊任務——就是要毀滅一切，把地球回復到過去！唯阿基德和朋友卻不苟同，他們渴望走出未來。...

在東京灣建立了一座巨大設施「海之邊緣（Edge of Ocean）」，並於5月1日展開東京高峰會，那天出動了約有2萬2000名的警力進行維安，但在某一天卻突然發生了一場爆炸事故。 那個時候，操縱著全國公安警察隸屬於警察廳的秘密組織．通稱「零（Zero）」所屬的安室透，在那裡出現了身影。然而他的身份是，毛利小五郎旗下弟子的私立偵探「安室透」、臥底於黑暗組織的成員「波本」，以及真實身分為公安警察的「降谷零」，持有著三個面相的重要人物。 江戶川柯南對於這起案件的時間點感到懷疑，發生的時間並不是當天...