電影: Masami Toyoshima

真新鎮的小智以成為寶可夢大師為目標，但他啟程的第一天卻睡過了頭，使他沒能拿到三個初學者寶可夢（妙蛙種子、傑尼龜、小火龍）中的任何一個，而是得到一隻不願意進入寶貝球的皮卡丘。儘管小智很希望與皮卡丘成為朋友，但皮卡丘不領情，不斷以電擊攻擊小智，他的某次攻擊意外命中了烈雀，憤怒的烈雀群起追擊小智與皮卡丘，小智希望皮卡丘進入球中以免受傷害，而受傷的皮卡丘看到小智保護自己的背影，決定成為小智的夥伴。就在此時，傳說的寶可夢鳳王飛過現出彩虹的天空，留下一根彩虹羽毛給小智。...

在橘子群島一帶旅行的小智等人，某日在乘船時意外被暴風雨吹至當中的一個島嶼-亞西亞島，當地適逢慶典，他們結識少女芙蘆拉等居民，並得知流傳島上的古老傳說。 就在同時，貪婪的收藏家吉爾露太，為了滿足自己的收藏慾望，捕捉了傳說中神聖不可侵犯的的火焰鳥與閃電鳥，甚至想進一步捕捉急凍鳥，以引出傳說中的海之神-洛奇亞，致使傳說成真，各處氣候變異、關都，城都地區步向毀滅，小智決定挺身而出前往化解危機.......

綠色草原，是個能夠使人和神奇寶貝都心境安寧的地方，在這裡住著秀力博士和他的女兒小美，有一天，秀力博士在遺跡裡研究神秘神奇寶貝-未知圖騰的時候，不小心被吸進異次元內，小美十分思念父親，沒想到竟因此喚醒了未知圖騰。未知圖騰將小美的心靈以結晶化呈現，最後更創造出小美最喜歡的傳說神奇寶貝-炎帝，小美因此誤以為爸爸變成炎帝的模樣回來了，炎帝為了實現小美的心願，並充當他的爸爸。小智的媽媽和秀力博士是舊識，因為擔心小美而趕來，在這碰到剛結束對戰來到這裡休息的小智他們。沒想到炎帝卻從結晶塔中出現，將小智的媽媽暫...